Court se trouve à 5 km à vol d’oiseau de Moutier, le long du cours de la Birse. Le territoire communal culmine à 1045 m sur le Mont-Girod, à 1280 m sur le Graitery et à 1405 m sur la chaîne de Montoz (Montagne-de-Granges).
A l’est, le territoire communal se prolonge en direction de la vallée du Chaluet, un petit affluent de la Birse. La superficie communale est occupé à raison de 4 % par l’habitat, 61 % par la forêt et les pâturages boisés, 34 % par les zones agricoles et 1 % de sol improductif.